Identifikasi Keragaman Gen Hsp70 (Heat Shock Protein 70) Cds (Coding Dna Sequence) Pada Sapi Pesisir Menggunakan Metode Sekuensing

Febriana, Anita (2026) Identifikasi Keragaman Gen Hsp70 (Heat Shock Protein 70) Cds (Coding Dna Sequence) Pada Sapi Pesisir Menggunakan Metode Sekuensing. S1 thesis, Univversitas Andalas.

	Text (01. Cover dan Abstrak) Cover dan Abstrak.pdf - Published Version Download (272kB)
	Text (02. BAB I) BAB I.pdf - Published Version Download (283kB)
	Text (03. BAB V) BAB V.pdf - Published Version Download (268kB)
	Text (04. Daftar Pustaka) Daftar Pustaka .pdf - Published Version Download (262kB)
	Text (05. Skripsi Fulltext) Skripsi Full Text docx.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengidentifikasi tingkat keragaman gen HSP70 (Heat Shock Protein 70) pada sapi Pesisir menggunakan metode sekuensing. Sampel yang digunakan pada penelitian yaitu 95 sampel darah sapi Pesisir. Sampel darah tersebut terlebih dahulu diekstraksi, kemudian kualitas DNA diuji sebelum dilakukan proses amplifikasi menggunakan metode Polymerase Chain Reaction (PCR). Amplifikasi dilakukan dengan menggunakan sepasang primer forward 5‘CGCAGATCCTCTTCACCGAT-3‘ dan primer reverse 5‘CCTGGTGATGGACGTGTAGA-3’ yang menghasilkan fragmen DNA sepanjang 963 bp. Produk hasil PCR selanjutnya disekuensing melalui jasa 1st BASE Malaysia. Data hasil sekuensing dialigment melalui proses penjajaran sekuen menggunakan softwear MEGA 12, sedangkan kualitas kromatogram diamati dengan bantuan softwear FinchTV. Hasil penelitian menunjukkan bahwa pada gen HSP70 teridentifikasi sebanyak 12 titik mutasi pada daerah CDS yaitu pada posisi g.12451 C>T, g.12458 C>T, g.12500 A>G, g.12550 C>T, g.12553 G>A, g.12583 A>G, g.12583 A>G, g.13000 G>C, g.13025 C>T, g.13115 Insersi C, g.12437 Delesi A, g.12438 Delesi A. Pada gen HSP70 sapi Pesisir ditemukan 33 pola haplotipe. Berdasarkan hasil penelitian tersebut, dapat disimpulkan bahwa gen HSP70 pada sapi Pesisir menunjukkan adanya keragaman genetik, sehingga berpotensi untuk diasosiasikan dengan profil hematologi pada sapi Pesisir.

Actions (login required)

View Item