Analisis Keragaman Genetik Aren (Arenga pinnata Merr.) Asal Sumatra Barat Menggunakan Penanda Simple Sequence Repeat (SSR)

Exel, Valentino Zebua (2025) Analisis Keragaman Genetik Aren (Arenga pinnata Merr.) Asal Sumatra Barat Menggunakan Penanda Simple Sequence Repeat (SSR). S2 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) Tesis_Cover.pdf - Published Version Download (909kB)
	Text (BAB 1) Tesis_BAB-1.pdf - Published Version Download (88kB)
	Text (BAB 5) Tesis_BAB-5.pdf - Published Version Download (62kB)
	Text (Daftar Pustaka) Tesis_Daftar-Pustaka.pdf - Published Version Download (121kB)
	Text (Tesis Full) Tesis_Full.pdf - Published Version Download (612kB)

Abstract

Aren (Arenga pinnata Merr.) merupakan salah satu tanaman perkebunan yang memiliki prospek pengembangan yang masih sangat luas. Keragaman aren yang luas membuka potensi pengembangan yang sangat besar, sehingga tidak heran banyak upaya pemuliaan tanaman aren yang dilakukan. Eksplorasi dan identifikasi tanaman aren lokal telah dilakukan pada beberapa daerah yang bertujuan untuk melihat keragaman yang ada dan mencari keragaman-keragaman baru yang berpotensi menjadi plasma nutfah yang berharga. Metode yang sering digunakan adalah pengamatan dan analisis pada perbedaan morfologi tanaman dengan bantuan penanda morfologi berupa deskriptor. Akan tetapi, morfologi tanaman dapat dipengaruhi oleh lingkungan tumbuh, sehingga data pengamatan yang didapatkan bisa memunculkan bias yang besar. Untuk menutupi kekurangan yang terdapat pada penanda morfologi, solusinya adalah dengan pendekatan molekuler dengan penanda Simple Sequence Repeat (SSR). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tingkat keragaman genetik aren yang berasal dari berbagai daerah di Sumatra Barat menggunakan penanda Simple Sequence Repeat (SSR). Penelitian telah dilaksanakan di Laboratorium Uji Mutu, Balai Perakitan dan Pengujian Tanaman Buah Tropika, Kabupaten Solok, Sumatra Barat. dari Mei – Juni 2025. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif kuantitatif dengan pendekatan observasional dan analisis genetik. Pendekatan observasi dimulai dengan pengambilan sampel daun aren di berbagai daerah, dilanjutkan dengan analisis genetik dari isolasi DNA, elektroforesis, dan amplifikasi DNA. Analisis yang dilakukan meliputi skoring pita DNA, analisis SSR, analisis keragaman genetik, dan perbandingan hasil keragaman genetik morfologi dan molekuler. Hasil penelitian menunjukkan bahwa penanda SSR dapat digunakan untuk melihat keragaman genetik aren secara molekuler. Hal ini dapat dilihat dari nilai heterozigositas dan PIC keempat primer yang digunakan termasuk tinggi, kecuali AD679 yang hanya dapat membaca pita monomorfik. Keragaman genetik aren di Sumatra Barat termasuk kategori rendah. Hal ini didasarkan pada nilai Shannon Index (I) yang rendah dan banyaknya ditemukan pita monomorfik. Keragaman morfologi dan molekuler aren di Sumatra Barat tidak berkorelasi berdasarkan uji Mantel, namun memperlihatkan beberapa kemiripan pola pengelompokan pada perbandingan dendogram secara visual.

Actions (login required)

View Item