Deteksi dan Karakterisasi Paramyxovirus pada Satwa Liar yang Dikonsumsi di Kabupaten Bolaang Mongondow dan Kabupaten Minahasa, Sulawesi Utara

Antselino, Zaki Pratama (2026) Deteksi dan Karakterisasi Paramyxovirus pada Satwa Liar yang Dikonsumsi di Kabupaten Bolaang Mongondow dan Kabupaten Minahasa, Sulawesi Utara. S1 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) Cover dan Abstrak.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 19 August 2027. Download (467kB) | Request a copy
	Text (BAB 1) BAB 1.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 19 August 2027. Download (272kB) | Request a copy
	Text (BAB Akhir) BAB Akhir.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 19 August 2027. Download (238kB) | Request a copy
	Text (Daftar Pustaka) Daftar Pustaka.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 19 August 2027. Download (353kB) | Request a copy
	Text (Tugas Akhir Fulltext) Tugas Akhir Fulltext.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 19 August 2027. Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Paramyxovirus merupakan virus RNA dari famili Paramyxoviridae yang berpotensi menyebabkan zoonosis. Tingginya aktivitas perburuan, perdagangan, dan konsumsi satwa liar di Kabupaten Bolaang Mongondow dan Kabupaten Minahasa, Sulawesi Utara, meningkatkan risiko penularan virus dari satwa liar ke manusia. Penelitian ini bertujuan mendeteksi dan mengarakterisasi paramyxovirus pada satwa liar yang dikonsumsi di kedua wilayah tersebut. Penelitian deskriptif ini menggunakan 48 sampel RNA yang berasal dari oral swab dan rectal swab beberapa spesies kelelawar dan rodensia. Deteksi dilakukan menggunakan One-Step Semi-Nested Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dengan primer broad-range yang menargetkan gen Large polymerase (gen L). Sampel positif selanjutnya dianalisis menggunakan Next Generation Sequencing berbasis Oxford Nanopore Technologies, Basic Local Alignment Search Tool (BLAST), dan analisis filogenetik menggunakan MEGA12. Hasil penelitian menunjukkan tujuh sampel menghasilkan pita DNA berukuran sekitar 500 bp. Analisis BLAST dan filogenetik menunjukkan bahwa seluruh sekuens memiliki tingkat kemiripan sekitar 98% dan berkelompok dalam satu klad dengan Avian orthoavulavirus 1 (Newcastle disease virus). Analisis sequence mapping juga menunjukkan bahwa sekuens yang diperoleh memiliki kesesuaian dominan dengan spesimen pembanding yang berasal dari aviar (host match). Penelitian ini mengidentifikasi sekuens yang berkerabat dekat dengan Avian orthoavulavirus 1 pada spesimen yang dianalisis. Karakteristik sekuens tersebut mengindikasikan bahwa hasil deteksi perlu diinterpretasikan secara hati-hati, terutama dalam konteks deteksi virus lintas spesies. Konfirmasi dan validasi metodologis lebih lanjut diperlukan untuk memastikan identitas sekuens yang diperoleh pada penelitian skrining virologi satwa liar.

Actions (login required)

View Item