INTERAKSI MOLEKULER PROTEIN REPLICASE GEMINIVIRUS ISOLAT PESISIR SELATAN DENGAN DOMAIN ANKYRIN-NPR1

muhammad, fadli (2019) INTERAKSI MOLEKULER PROTEIN REPLICASE GEMINIVIRUS ISOLAT PESISIR SELATAN DENGAN DOMAIN ANKYRIN-NPR1. Masters thesis, IOP.

Preview	Text (abstrak) 1. Cover - Abstrak.pdf - Published Version Download (432kB) | Preview
Preview	Text (bab I) 2. BAB 1 Pendahuluan.pdf - Published Version Download (637kB) | Preview
Preview	Text (bab v) 3. BAB V Penutup.pdf - Published Version Download (556kB) | Preview
Preview	Text (daftar pustaka) 4. Daftar Kepustakaan.pdf - Published Version Download (621kB) | Preview
	Text (tesis full text) 5. tesis utuh_compressed.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Mengetahui pengaruh interaksi antra protein Rep geminivirus dengan domain ankyrin NPR1 (Non-expressor of Pathogenesis-Related Gene 1) bertujuan untuk memahami bagaimana penekanan ekspresi gen – gen ketahanan pada saat terjadi serangan patogen. Interaksi yang terjadi akan mempengaruhi kerja dari protein NPR1 sebagai faktor transkripsi. Metoda yang digunakan untuk melakukan uji interaksi yaitu EMSA (Electrophoretic Mobility Shift Assay). Perbandingan protein dengan asam nukleat yang digunakan yaitu 7,6 ng/ µL Rep x ankyrin :100 ng/ µL dan 7,6 ng/ µL Rep x ankyrin :5 ng/ µL mampu memvisualisasikan hasil binding. Simulasi permodelan dan mutasi protein utuh NPR1 juga dilakukan untuk memahami dampak dari interaksi yang terjadi. Analisis 3 dimensi protein NPR1 memiliki posisi binding dan pola interaksi yang berbeda dengan protein mutan. Kompleks yang terbentuk antara protein NPR1 non mutan dengan protein Rep memiliki skor docking -542,04 sedangkan kompleks antara NPR1 mutan dengan protein Rep memiliki skor docking -523,56.

Actions (login required)

View Item