IDENTIFIKASI VARIASI SEKUEN DAN ANALISIS HUBUNGAN KEKERABATAN GEN MEROZOITE SURFACE PROTEIN 1 (MSP-1) PLASMODIUM FALCIPARUM ISOLAT KEPULAUAN MENTAWAI

Astaripisesa, Fitri (2011) IDENTIFIKASI VARIASI SEKUEN DAN ANALISIS HUBUNGAN KEKERABATAN GEN MEROZOITE SURFACE PROTEIN 1 (MSP-1) PLASMODIUM FALCIPARUM ISOLAT KEPULAUAN MENTAWAI. S2 thesis, Universitas Andalas.

Text (Skripsi Full Text) S2 Pasca Sarjana 2011 Fitri Astari Pisesa 07212007.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (12MB)

Abstract

Malaria adalah penyakit yang menginfeksi manusia, burung, dan primata yang telah dikenal sejak zaman Yunani. Secara klinis penyakit malaria mudah dikenal, karena ditandai dengan demam naik turun dan teratur yang disertai menggigil, dan splenomegali, yaitu limpa yang membesar dan menjadi keras (Muljono, 2003). Penelitian ini telah dilaksanakan di Laboratorium Biomedik, Fakultas Kedokteran, dan di Laboratorium Bioteknologi dan Pemuliaan Tanaman, Fakultas Pertanian, Universitas Andalas dari bulan Agustus 2010 sampai dengan bulan Juni 2011. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui variasi sekuens gen MSP-1 P. falciparum isolat Kepulauan Mentawai, dan mengetahui hubungan kekerabatan P falciparum isolat Kepulauan Mentawai dengan P. falciparum daerah endemik lainnya berdasarkan data sekuens gen MSP-1. Sampel dikoleksi dari beberapa Puskesmas yang berada di Kecamatan Sipora Utara Kabupaten Kepulauan Mentawai yang berjumlah 30 orang dan dilakukan skrining terhadap gen MSP-1 dan alel-alelnya (K1, Mad-20, dan RO33), Hasil penelitian berdasarkan analisis BLAST NCBI menunjukkan bahwa sekuens gen MSP-1 isolat Kepulauan Mentawai bervariasi dibandingkan dengan database GeneBank NCBI dilihat dari kejadian substitusi dan insersi-delesi (67.88%). Variasi sekuens juga terjadi pada alel K1, Mad20 dan RO33 dengan kejadian substitusi dan insersi-delesi sebesar 58.28%, 30.94%, dan 79.95%, berturut-turut. Sedangkan untuk analisis kekerabatan P. falciparum isolat Kepulauan Mentawai terhadap MSP-1, K1, dan RO33 berdasarkan analisis CLUSTAL W memiliki perbedaan kekerabatan dengan database GeneBank sebesar 52%, dan Mad-20 sebesar 15%. Kesimpulan penelitian ini adalah, (1) Terdapat variasi pada sekuens gen MSP-1 isolat Kepulauan Mentawai, (2) Terdapat hubungan kekerabatan P. falciparum isolat Kepulauan Mentawai dengan P. falciparum daerah endemik lainnya. Sebagai saran, dengan ditemukannya lebih dari satu alel MSP-1 dalam tubuh pasien malaria falsiparum melalui skrining PCR, maka diindikasikan akan memperparah infeksi oleh parasit.

Actions (login required)

View Item