Deteksi Mutasi Gen rpoB pada Rifampicin Resistant Tuberculosis (RR-TB) Isolat Lokal Indonesia Menggunakan Single Pass Sequencing

Satiya, Selin Faysa (2025) Deteksi Mutasi Gen rpoB pada Rifampicin Resistant Tuberculosis (RR-TB) Isolat Lokal Indonesia Menggunakan Single Pass Sequencing. S1 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) ABSTRAK.pdf - Published Version Download (406kB)
	Text (BAB 1 Pendahuluan) BAB I PENDAHULUAN.pdf - Published Version Download (710kB)
	Text (BAB 6 Penutup) BAB VI PENUTUP.pdf - Published Version Download (272kB)
	Text (Daftar Pustaka) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (360kB)
	Text (Full Text) SKRIPSI_FULL TEXT.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (13MB) | Request a copy

Abstract

Penyakit tuberkulosis (TBC) menjadi tantangan global saat ini, terutama di Indonesia yang menempati peringkat kedua kasus TB tertinggi di dunia. Mutasi pada gen rpoB Mycobacterium tuberculosis (Mtb) merupakan penyebab utama resistensi terhadap rifampisin, antibiotik lini pertama TB. Penelitian ini bertujuan mendeteksi mutasi gen rpoB pada isolat lokal RR-TB di Indonesia menggunakan Single Pass Sequencing. Sampel sputum pasien presumtif RR-TB diambil dari Padang (5 sampel) dan Yogyakarta (1 sampel). DNA diisolasi dan diamplifikasi dengan PCR. Hanya 2 sampel yang dilanjutkan untuk analisis mutasi dengan Single Pass Sequencing. Hasil menunjukkan dua mutasi nonsynonymous missense pada kodon 450 gen rpoB, yaitu S450L pada sampel Padang dan S450W pada sampel Yogyakarta. Peak dibaca menggunakan software Geneious primer dan kualitas basa dinilai menggunakan Scoring Phred interpretation. Mutasi S450L memiliki Phred Score rendah (Q < 20), sementara S450W memiliki kualitas tinggi (Q ≥ 40). Kedua mutasi ini mengganggu afinitas rifampisin terhadap RNA polimerase, berkontribusi pada resistensi obat. Penelitian ini menambah wawasan mengenai varian mutasi gen rpoB Mycobacterium tuberculosis isolat lokal Indonesia.

Actions (login required)

View Item