STUDI BIOINFORMATIKA UNTUK INTERAKSI MOLEKULER BEDAQUILINE PADA STRUKTUR APO, KOMPLEKS, DAN MUTAN PADA TARGET GEN PKS13-TE

Nabiila, Afiifah (2025) STUDI BIOINFORMATIKA UNTUK INTERAKSI MOLEKULER BEDAQUILINE PADA STRUKTUR APO, KOMPLEKS, DAN MUTAN PADA TARGET GEN PKS13-TE. S1 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) Text (Cover dan Abstrak).pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 28 February 2026. Download (512kB) | Request a copy
	Text (BAB I Pendahuluan) BAB I.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 28 February 2026. Download (378kB) | Request a copy
	Text (BAB V Penutup) SKRIPSI FULL TEXT (2)-halaman-2 (1)_compressed (1).pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 28 February 2026. Download (94kB) | Request a copy
	Text (Daftar Pustaka) SKRIPSI FULL TEXT (2)-halaman-2.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 28 February 2026. Download (453kB) | Request a copy
	Text (Skripsi Full Text) SKRIPSI FULL TEXT (2).pdf - Published Version Restricted to Repository staff only until 28 February 2026. Download (2MB) | Request a copy

Abstract

Bedaquiline adalah obat anti-TB yang disetujui oleh FDA untuk pengobatan Multi Drug Resistant-Tuberculosis (MDR-TB). Saat ini, Gen Pks13-Te (Polyketide Synthase 13 Thioesterase) telah diidentifikasi sebagai salah satu gen yang terlibat dalam biosintesis asam mikolat pada Mycobacterium tuberculosis. Penelitian ini bertujuan untuk melihat interaksi Gen Pks13-Te dengan bedaquiline serta memprediksi absorpsi, distribusi, metabolisme, ekskresi, dan toksisitas (ADMET). Penelitian ini menggunakan molecular docking dan molecular dynamics. Hasil molecular docking menunjukkan bahwa protein struktur kompleks memiliki nilai Ligand Efficiency (LE) paling tinggi yaitu -0,341 pada rantai A dan -0,366 pada rantai B serta memiliki jumlah kesamaan ikatan asam amino paling banyak dengan native ligandnya. Sebagai perbandingan, protein struktur apo menunjukkan nilai Ligand Efficiency (LE) -0,258 untuk rantai A dan -0,257 untuk rantai B. Sementara itu, protein struktur mutan menunjukkan nilai Ligand Efficiency (LE) yang paling rendah yaitu pada rantai A -0,176 dan pada rantai B 0,264. Molecular dynamics selama 100 ns menunjukkan Bedaquiline berinteraksi lebih stabil dengan protein struktur kompleks pada rantai A dan rantai B dibandingkan dengan protein struktur mutan dan struktur apo. Selain itu, prediksi ADMET untuk bedaquiline dan native ligand dari protein struktur kompleks menunjukkan profil ADMET yang baik. Berdasarkan hasil kajian in silico, Bedaquiline lebih stabil berinteraksi dengan protein struktur kompleks.

Actions (login required)

View Item