STUDI EKSPRESI GEN – GEN YANG TERLIBAT DALAM BIOSINTESIS KATEKIN DAN PENENTUAN KADAR KATEKIN PADA TANAMAN GAMBIR (Uncaria gambir (Hunter) Roxb.)

Epi, Supriwardi (2024) STUDI EKSPRESI GEN – GEN YANG TERLIBAT DALAM BIOSINTESIS KATEKIN DAN PENENTUAN KADAR KATEKIN PADA TANAMAN GAMBIR (Uncaria gambir (Hunter) Roxb.). S3 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) 01-Cover dan Abstrak.pdf - Published Version Download (409kB)
	Text (BAB 1) 02-BAB 1.pdf - Published Version Download (462kB)
	Text (BAB 5) 03-BAB 5.pdf - Published Version Download (428kB)
	Text (Daftar Pustaka) 04-Daftar Pustaka.pdf - Published Version Download (353kB)
	Text (Disertasi Full Text) Disertasi Fulltext.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (6MB) | Request a copy

Abstract

Penelitian ini berhasil mengidentifikasi dan membandingkan variasi genetik serta kandungan katekin pada empat varietas Uncaria gambir : Riau, Mancik, Cubadak, dan Udang. Sekuen DNA dari keempat varietas telah diunggah ke database NCBI, dengan panjang basa nukleotida 644-646 bp. Analisis jarak intraspesifik dan interspesifik berhasil membedakan Uncaria gambir dari spesies Uncaria lainnya, dan pohon filogenetik menunjukkan Uncaria gambir terkelompok terpisah dari spesies lain dalam genus Uncaria. Penanda molekuler SRAP digunakan untuk mengidentifikasi variasi genetik. Primer 'E' menunjukkan polimorfisme tertinggi dan analisis pohon filogenetik mengelompokkan Uncaria gambir Riau dalam klad berbeda. Konsentrasi katekin yang diukur menggunakan HPLC menunjukkan Uncaria gambir Mancik memiliki kandungan katekin tertinggi sebesar 207,88 mg/L, diikuti oleh Uncaria gambir Cubadak, Udang, dan Riau dengan konsentrasi secara berurutan sebesar konsentrasi masing-masing sebesar 202,13 mg/L, 180,12 mg/L, dan 170,26 mg/L. Pengukuran katekin pada daun kedua (Gambir_SL) dan keempat (Gambir_FL) menunjukkan daun kedua mengandung lebih banyak katekin, meskipun perbedaan ini tidak signifikan secara statistik (p<0,05). Hasil LC-MS mendukung temuan ini. RNA-seq menunjukkan perbedaan signifikan dalam ekspresi gen antara daun kedua dan keempat, dengan 682 gen mengalami perubahan ekspresi signifikan, termasuk penurunan ekspresi gen Leucoanthocyanidin Reductase (LAR) dan Anthocyanidin Synthase (ANS) pada Gambir_SL dengan nilai FDR secara berurutan sebesar 2,14E-05 dan 0,042258. Hasil HPLC menunjukkan asosiasi negatif antara ekspresi LAR dan kandungan katekin, yang juga didukung oleh penelitian sebelumnya. Analisis menunjukkan faktor transkripsi MYB dan bHLH, bersama WD40, berperan dalam regulasi ekspresi LAR. Berdasarkan hasil temuan pada penelitian ini, gen LAR dan ANS merupakan gen kunci yang terkait dengan kandungan katekin pada tanaman gambir.

Actions (login required)

View Item