Andre, Prima Rahmadhana (2019) ANALISIS VARIASI GENETIK GEN L1 HPV TIPE 16 ASAL SUMATERA BARAT DAN TRANSLASI PROTEIN GEN L1 HPV 16 SECARA IN SILICO. Masters thesis, Universitas Andalas.
![[img]](http://scholar.unand.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (Cover dan Abstrak)
Cover dan Abstrak.pdf - Published Version Download (247kB) |
|
Text (Bab 1 Pendahuluan)
Bab 1 Pendahuluan.pdf - Published Version Download (299kB) |
|
Text (BAB 5)
Bab 5 Kesimpulan dan Saran.pdf - Published Version Download (282kB) |
|
Text (Daftar Pustaka)
Daftar Pustaka.pdf - Published Version Download (316kB) |
|
Text (Tesis Full Text)
TESIS Full Text.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB) |
Abstract
Variasi nukleotida gen L1 terhadap data terkait di Gene Bank dilakukan dengan menggunakan 5 isolat DNA tipe 16 asal sumbar dimana setelah diamplifikasi hanya 2 yang berhasil di amplifikasi dan dilanjutkan dengan tahap sekuensing yakni sampel 3 dan sampel 4. Analisis dilakukan menggunakan data sekuensing untuk kemudian dilakukan blast, konstruksi pohon filogenetik dan visualisasi protein secara in silico. Hasil analisa data sekuensing menunjukkan sampel 3 memiliki kekerabatan dengan sekuen L1 di Gene Bank KU.9551191.1 dan sampel 4 memiliki kekerabatan dengan sekuen L1 JX313706.1. Analisa jarak genetik menggunakan Mega 6 menunjukkan ada selisih jarak kekerabatan antara sampel 3 dan sampel 4 sejauh 0,017 %.
| Item Type: | Thesis (Masters) |
|---|---|
| Primary Supervisor: | Prof. Dr. Marlina, M.S., Apt. |
| Uncontrolled Keywords: | Gen L1, pohon filogenetik, primer BLAST, HPV 16, sekuensing |
| Subjects: | Q Science > QR Microbiology |
| Divisions: | Pascasarjana (S2) |
| Depositing User: | s2 bioteknologi bioteknologi |
| Date Deposited: | 16 Feb 2024 04:58 |
| Last Modified: | 16 Feb 2024 04:58 |
| URI: | http://scholar.unand.ac.id/id/eprint/462116 |
Actions (login required)
 |
View Item |
Altmetric
Altmetric