Nurmia, Sari (2022) KARAKTERISTIK DNA BARCODING Rasbora jacobsoni Weber & de Beaufort, 1916 (CYPRINIDAE) DARI SIBERUT SELATAN. Diploma thesis, Universitas Andalas.
![[img]](http://scholar.unand.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (Cover dan Abstrak)
Cover dan Abstrak.pdf - Published Version Download (336kB) |
|
Text (BAB I (Pendahuluan))
BAB I (Pendahuluan).pdf - Published Version Download (209kB) |
|
Text (BAB Akhir (Penutup))
BAB Akhir (Penutup).pdf - Published Version Download (297kB) |
|
Text (Daftar Pustaka)
Daftar Pustaka.pdf - Published Version Download (448kB) |
|
Text (Skripsi Full Text)
Tugas Akhir Ilmiah Utuh.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (1MB) |
Abstract
Salah satu spesies ikan dari genus Rasbora adalah Rasbora jacobsoni. Ikan R. jacobsoni dapat ditemukan di Pesisir Barat Sumatra dan Siberut Selatan. Kepulauan Mentawai sudah terpisah sekitar 500.000 tahun lalu dari Sundaland sehingga terjadi perbedaan genetik antara R. jacobsoni Pesisir Barat Sumatra dan Siberut Selatan. Salah satu teknik molekuler untuk pengidentifikasian spesies secara tepat dan akurat adalah DNA barcode. Gen standar untuk pembuatan DNA barcode hewan adalah sitokrom oksidase subunit 1 (COI). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakteristik DNA barcoding dari R. jacobsoni asal Siberut Selatan. Penelitian ini telah dilaksanakan selama 6 bulan di Laboratorium Genetika dan Biomolekuler, Departemen Biologi, Universitas Andalas. Sampel yang digunakan dikoleksi secara langsung dari Sungai Kulukubuk dan Sungai Majobolu, Kecamatan Siberut Selatan, Kepulauan Mentawai. Sampel hati dari R. jacobsoni diisolasi, diamplifikasi dan disekuensing. Berdasarkan 630 bp gen COI delapan individu R. jacobsoni dan 24 sekuen pembanding yang dianalisis didapatkan 22 haplotipe dan R. jacobsoni Siberut Selatan berada pada haplotipe yang sama. Terdapat 22-39 basa mengalami mutasi transisi dan transversi, namun tidak mengubah asam amino yang dihasilkan. Terdapat 13 basa spesifik pada R. jacobsoni Siberut Selatan. R. jacobsoni Siberut Selatan tidak memiliki variasi genetik antar individunya serta memiliki nilai sequence divergence 3,92-6,58% dengan R. jacobsoni Pesisir Barat Sumatra dan sampel akuarium.
| Item Type: | Thesis (Diploma) |
|---|---|
| Primary Supervisor: | Prof. Dr. Dewi Imelda Roesma, M.Si |
| Uncontrolled Keywords: | DNA barcoding, Gen COI, Rasbora jacobsoni, Siberut selatan |
| Subjects: | Q Science > QH Natural history Q Science > QH Natural history > QH301 Biology |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam > Biologi |
| Depositing User: | S1 Biologi Biologi |
| Date Deposited: | 31 Aug 2022 02:59 |
| Last Modified: | 31 Aug 2022 02:59 |
| URI: | http://scholar.unand.ac.id/id/eprint/111475 |
Actions (login required)
 |
View Item |
