Potensi Senyawa Tetrapreniltoluquinone (TPTQ) Dari Tanaman Asam Kandis (Garcinia cowa Roxb) Terhadap Ekspresi Beberapa Protein Pada Kanker Secara In Silico

Fajar, Arya Pratama (2022) Potensi Senyawa Tetrapreniltoluquinone (TPTQ) Dari Tanaman Asam Kandis (Garcinia cowa Roxb) Terhadap Ekspresi Beberapa Protein Pada Kanker Secara In Silico. Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Cover dan Abstrak) COVER DAN ABSTRAK.pdf - Published Version Download (240kB) | Preview
Preview	Text (Bab 1 Pendahuluan) BAB I PENDAHULUAN.pdf - Published Version Download (188kB) | Preview
Preview	Text (Bab 5 Penutup) BAB V PENUTUP.pdf - Published Version Download (172kB) | Preview
Preview	Text (Daftar Pustaka) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (332kB) | Preview
	Text (Fulltext Skripsi) Skripsi Full Text_Fajar Arya Pratama_Skripsi Sarjana Farmasi (2).pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (3MB)

Abstract

Tetrapreniltoluquinone (TPTQ) merupakan senyawa turunan quinone berbentuk minyak kekuningan dan mempunyai 4 unit gugus isoprene yang terikat pada 5 geranil. Tujuan penelitian adalah untuk menjelaskan metode yang digunakan valid untuk menguji senyawa tetrapreniltoluquinone sebagai antikanker pada protein-protein kanker, menjelaskan nilai skor docking senyawa tetrapreniltoluquinone terhadap protein-protein kanker, serta menjelaskan ikatan antara senyawa tetrapreniltoluquinone dan protein-protein kanker. Protein-protein kanker (Kode PDB) di download di www.rscb.com . Selanjutnya dipreparasi menggunakan aplikasi YASARA dan Marvinsketch, kemudian kode PDB di validasi menggunakan aplikasi PLANTS dan YASARA. Kode-kode PDB yang valid atau nilai RMSD < 2 Å. Dari hasil validasi didapatkan 17 kode PDB yang valid. Kemudian kode PDB yang telah valid tersebut di dockingkan dengan senyawa tetrapreniltoluquinone. Dari hasil docking antara senyawa tetrapreniltoluquinone dengan kode PDB yang valid, didapatkan tiga hasil docking terbaik yaitu senyawa tetrapreniltoluquinone dengan 2HV5 didapatkan skor docking -133,0320, dan tetrapreniltoluquinone dengan 1ZUA skor docking yang didapat sebesar -117,1690. Kemudian hasil visualisasi 2D didapatkan bahwa senyawa tetrapreniltoluquinone berikatan dengan stabil pada reseptor AKR1B10 dengan kode PDB 2HV5, terikat langsung dengan 10 asam amino mementuk ikatan hydrogen dan 14 asam amino membentuk ikatan hidrofobik. Serta, senyawa tetrapreniltoluquinone berikatan langsung pada reseptor AKR1B10 dengan kode PDB 1ZUA, terikat pada 4 asam amino yang mementuk ikatan hydrogen dan 15 asam amino membentuk ikatan hidrofobik. Sehingga dapat disimpulkan bahwa senyawa tetrapreniltoluquinone merupakan senyawa yang dapat berikatan dengan sangat stabil pada reseptor AKR1B10, yang merupakan reseptor kanker paru-paru kecil (small lung cancer). Kata kunci : Tetrapreniltoluquinone, YASARA, PLANTS, Protein Kanker, AKR1B10, Kanker Paru-paru Kecil

Actions (login required)

View Item