KLONING GEN PENGKODE KITINASE-A (ChiA)DARI BAKTERI RIZOSFER (ISOLAT UBCR_12)

RAUDHATUL, FATIAH (2016) KLONING GEN PENGKODE KITINASE-A (ChiA)DARI BAKTERI RIZOSFER (ISOLAT UBCR_12). Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Abstrak) Abstrak.pdf - Published Version Download (142kB) | Preview
Preview	Text (BAB 1) Bab 1.pdf - Published Version Download (318kB) | Preview
Preview	Text (BAB 5) Bab 5.pdf - Published Version Download (111kB) | Preview
Preview	Text (Daftar Pustaka) Dapus.pdf - Published Version Download (240kB) | Preview
	Text (Tugas akhir full text) Tugas akhir full text RF.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (3MB)

Abstract

Kitinase berpotensi untuk mengontrol berbagai jenis fitopatogen yang mengandung kitin sebagai penyusun dinding selnya, seperti jamur. Dalam penelitian ini, gen pengkode kitinase-A (ChiA) dari isolat UBCR_12 diamplifikasi menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan dikloning ke E. coli DH5α menggunakan vektor pGEM-T Easy. Panjang DNA yang dikloning adalah 1780 bp. Hasil karakterisasinya menunjukkan bahwa DNA yang dikloning tersebut memeiliki kemiripan 97% dengan ChiA dari spesies Serratia plymuthica, tapi terjadi delesi 1 nukleotida pada urutan ke-192. Panjang Open Reading Frame-nya (ORF) diperkirakan 1465 bp (dari nukleotida 399 sampai 1763). Dengan demikian ORF ini menyandikan 454 asam amino. Hasil analisis domain menunjukkan bahwa gen putatif ChiA dari isolat UBCR_12 diperkirakan tidak memiliki domain peptida sinyal, tapi memiliki sebagian domain terminal-N yang lipatannya mirip fibronektin tipe III dan domain katalitik yang utuh. Penelitian selanjutnya perlu dilakukan uji fungsional dari gen ini, uji kemampuannya untuk menghidrolis koloid kitin dan kemampuannya menekan pertumbuhan jamur fitopatogen. Aktivitas enzim ChiA sebaiknya juga dibandingkan dengan subfamili kitinase lainnya (seperti ChiB dan ChiC). Rekayasa genetika juga mungkin dilakukan untuk meningkatkan efektifitasnya menghidrolisis kitin.

Actions (login required)

View Item