Studi Metode Isolasi DNA Berbasis Buffer Potassium Phosphate (KH2PO4) Untuk Tanaman Cabai

Muhammad, Arif Setiawan (2020) Studi Metode Isolasi DNA Berbasis Buffer Potassium Phosphate (KH2PO4) Untuk Tanaman Cabai. Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Cover dan Abstract) Abstract.pdf - Published Version Download (48kB) | Preview
Preview	Text (Bab 1 Pendahuluan) BAB I pendahuluan.pdf - Published Version Download (203kB) | Preview
Preview	Text (BAB V) BAB V.pdf - Published Version Download (24kB) | Preview
Preview	Text (Daftar Pustaka) Dafta Pustaka .pdf - Published Version Download (116kB) | Preview
	Text (Skripsi full) Skripsi Full text.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Isolasi DNA tanaman memainkan peranan penting dalam analisis molekuler sebagai langkah utama untuk melakukan penelitian di bidang biologi molekuler. Prosedur isolasi DNA yang baik harus memperhatikan beberapa aspek seperti kecepatan waktu yang diperlukan dalam proses isolasi DNA, sederhana, murah dan meminimalkan penggunaan senyawa kimia beracun. Metode CTAB, Dellaporta dan Kit isolasi merupakan metode yang paling banyak digunakan dalam mengisolasi DNA tanaman. Sayangnya metode CTAB dan Dellaporta menggunakan senyawa-senyawa kimia berbahaya bagi manusia. Sedangkan metode Kit membutuhkan biaya yang lebih mahal dibandingkan dengan metode CTAB dan Dellaporta. Buffer potasium phosphate telah dilaporkan mampu mengisolasi DNA dari darah dan bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk menguji metode isolasi DNA berbasis potasium phosphate pada tanaman cabai. Metode potassium phosphate memiliki durasi waktu yang relatif cepat, tidak menggunakan senyawa kimia berbahaya dan biaya yang dibutuhkan relatif murah jika dibandingkan dengan metode CTAB, Dellaporta dan Kit isolasi DNA. Pengujian integritas DNA hasil isolasi dilakukan melalui teknik amplifikasi TA Domain fragmen 3 NPR1 dan Promotor Distal fragmen 1 NPR1 yang dilanjutkan untuk disekuensing menggunakan jasa perusahaan 1st Base, Singapura. Hasil penyejajaran data sekuens TA Domain fragmen 3 NPR1 dan Promotor Distal fragmen 1 NPR1 dari metode potassium phosphate menunjukkan kesamaan urutan nukleotida sebesar 100% dengan metode CTAB, Dellaporta dan Kit isolasi dan tidak ditemukan adanya variasi nuklteotida dengan ketiga metode pembanding. Hasil tersebut, membuktikan bahwa metode isolasi DNA berbasis buffer potassium phosphate dapat digunakan sebagai alternatif, khususnya untuk proses yang tidak membutuhkan konsentrasi DNA dalam jumlah besar. Kata kunci: alignment, elektroforesis, isolasi DNA, PCR, sekuensing

Actions (login required)

View Item