Variasi Molekuler Gen L1 Human Papillomavirus Tipe 16 Dari Isolat Pasien Kanker Serviks

NOFRI, EKA YULIANDI (2019) Variasi Molekuler Gen L1 Human Papillomavirus Tipe 16 Dari Isolat Pasien Kanker Serviks. Masters thesis, FAKULTAS KEDOKTERAN.

Preview	Text (Cover Tesis) cover ThESIS.pdf - Published Version Download (101kB) | Preview
Preview	Text (Pendahuluan) BAB I.pdf - Published Version Download (97kB) | Preview
Preview	Text (PENUTUP) BAB VII.pdf - Published Version Download (108kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (148kB) | Preview
	Text (FULL TEXT) full tex.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (3MB)

Abstract

Kanker serviks merupakan kanker kedua terbayak di Dunia setelah kanker payudara. Kanker serviks disebabkan oleh infeksi Human papillomavirus (HPV) tipe high-risk salah satunya tipe 16. Struktur genom HPV 16 tersusun atas protein L1 yang menyusun kapsid virus dan memiliki peran penting dalam infeksi epitel serviks. Sekuen lengkap gen L1 dapat memberikan informasi yang berguna dalam studi molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk melihat sekuen lengkap Gen L1 HPV tipe 16, variasi molekuler gen L1 dan melihat kekerabatan filogenik serta mengidentifikasi Open Reading frame. Penelitian ini merupakan deskriptif yang dilakukan terhadap 26 isolat kanker serviks di Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Adalas dari bulan Februari sampai Desember 2018. Terdapat 26 fragmen Gen L1 yang diamplifikasi dengan menggunakan metode PCR dan sekuensing untuk melihat urutan basa nukleotida. Sekuen urutan basa nukleotida kemudian dimasukkan dalam program filogenetik (MEGA.6). Pada penelitian ini didapatkan SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) pada semua sampel HPV 16 berupa C/G (6240), A/G (6432), T/G (6686), C/T (6823) serta insersi basa nukleotida ACT (6901) dan dikuti delesi basa GAT (6953) terjadinya variasi disepanjang sekuen isolat sampel yang diamati dapat menyebabkan terjadinya perubahan asam amino dan penting dalam perbedaan respon imunologi host. Hasil konstruksi pohon filogenik 26 pragmen L1 menunjukkan berada dalam satu lineage dengan Varian Asia dimana isolatnya berasal dari India, Thailand, China dan Jepang

Actions (login required)

View Item