Analisis Filogenetik dan Haplotype Network Kelinci Belang Sumatra (Nesolagus netscheri Schlegel, 1880) dengan Spesies Lain dalam Ordo Lagomorpha berdasarkan Gen Sitokrom b (Cytb)

Dhea, Apriano Aurora (2025) Analisis Filogenetik dan Haplotype Network Kelinci Belang Sumatra (Nesolagus netscheri Schlegel, 1880) dengan Spesies Lain dalam Ordo Lagomorpha berdasarkan Gen Sitokrom b (Cytb). S2 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) Cover dan Abstrak_Dhea Apriano Aurora_2320421012.pdf - Published Version Download (427kB)
	Text (BAB 1 Pendahuluan) BAB 1 Pendahuluan_Dhea Apriano Aurora_2320421012.pdf - Published Version Download (218kB)
	Text (BAB 5 Penutup) BAB 5 Penutup_Dhea Apriano Aurora_2320421012.pdf - Published Version Download (331kB)
	Text (Daftar Pustaka) Daftar Pustaka_Dhea Apriano Aurora_2320421012.pdf - Published Version Download (497kB)
	Text (Tesis Full text) Tesis Full text_Dhea Apriano Aurora_2320421012.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (6MB) | Request a copy

Abstract

Kelinci Belang Sumatra (Nesolagus netscheri) merupakan salah satu hewan endemik Pulau Sumatera yang memiliki kemiripan morfologi yang tinggi dengan Nesolagus timminsi yang berada di Pegunungan Annam, Vietnam. Oleh karena itu, perlu dilakukan analisis filogenetik dan haplotype network untuk memastikan kedua spesies ini berbeda. Gen yang digunakan untuk analisis filogenetik dan haplotype network adalah gen Cytochrome b (cytb). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan filogenetik dan haplotype network N. netscheri dengan spesies lainnya dalam Ordo Lagomorpha. Penelitian ini telah dilaksanakan dari Februari sampai Desember 2024 di Laboratorium Genetika dan Biomolekuler, Departemen Biologi, Universitas Andalas. Dalam penelitian ini digunakan sampel jaringan otot (daging) dari dua individu N. netscheri yang berasal dari Saniang Baka, Sumatra Barat dan Rimba Candi Pagar Alam, Sumatra Selatan. Sampel jaringan otot paha diisolasi, diamplifikasi dan disekuensing. Berdasarkan 694 bp yang dianalisis dengan 53 sekuen pembanding, diketahui bahwa kedua sampel N. netscheri (KS_SNB dan KS_SMSL) memiliki delapan perbedaan basa nukleotida yang merubah satu asam amino dengan nilai jarak genetik 1,17%. Kedua sampel N. netscheri (KS_SNB dan KS_SMSL) dengan N. timminsi memiliki 25 perbedaan basa nukleotida yang merubah 5 asam amino dengan jarak genetik 2, 86% - 3, 47%. Dari 55 sekuen yang dianalisis (2 N. netscheri dan 53 sekuen pembanding) didapatkan 55 haplotype yang berbeda.

Actions (login required)

View Item