Analisis Epidemiologi Molekuler Whole Genome Sequencing (WGS) Varian Virus SARS-CoV-2 di Sumatera Barat Tahun 2020 – 2022

Farashanda, Meysha (2025) Analisis Epidemiologi Molekuler Whole Genome Sequencing (WGS) Varian Virus SARS-CoV-2 di Sumatera Barat Tahun 2020 – 2022. S2 thesis, Universitas Andalas.

	Text (Abstrak) Abstrak + Cover.pdf - Published Version Download (188kB)
	Text (BAB 1) BAB 1.pdf - Published Version Download (132kB)
	Text (Penutup) BAB Penutup.pdf - Published Version Download (102kB)
	Text (Daftar Pustaka) Daftar Pustaka.pdf - Published Version Download (155kB)
	Text (Full Thesis) Full Text-Tesis Meysha.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (8MB) | Request a copy

Abstract

Tujuan Penelitian Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi varian virus SARS-CoV-2 dan penyebarannya di Provinsi Sumatera Barat pada tahun 2020 hingga 2022. Metode Penelitian ini memanfaatkan data yang ada pada hasil Whole Genome Sequencing (WGS) di Laboratorium Pusat Diagnostik dan Riset Penyakit Infeksi (PDRPI) FK Unand dengan format FASTA yang di dapat melalui GISAID. Data tersebut merupakan data sampling yang diperoleh dari sampel pasien positif COVID-19 pada Puskesmas, Rumah Sakit, dan Laboratorium di Provinsi Sumatera Barat. Identifikasi varian dengan menggunakan analisis filogenetik dan penyebaran varian dengan melakukan analisis haplotype. Untuk mengetahui karakteristik varian virus SARS-CoV-2 secara spesifik peneliti melakukan analisis karakteristik individu, fasilitas kesehatan, dan daerah terhadap varian virus SARS-CoV-2 di Provinsi Sumatera Barat. Hasil Penelitian ini menganalisis 198 sekuens genom SARS-CoV-2 di Sumatera Barat (2020-2022) dan diperoleh hasil tiga varian utama : (Unassigned (53%), Delta (7,6%), dan Omicron (39,4%). Penyebaran dari ketiga varian virus SARS-CoV-2 telah menyebar ke berbagai wilayah di Sumatera Barat dengan perbedaan varian yang memungkinkan dipengaruhi oleh mobilitas dan interaksi antar wilayah. Penelitian juga menemukan hubungan signifikan antara varian virus dengan jenis kelamin, umur, waktu, serajat keparahan, dan sarana kesehatan (p-value <0,05). Kesimpulan Hasil penelitian menunjukkan hubungan signifikan antara jenis kelamin, umur, waktu, derajat keparahan, dan sarana kesehatan dengan varian virus SARS-CoV-2 di Provinsi Sumatera Barat tahun 2020 - 2022.

Actions (login required)

View Item