DETEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PATOGEN TULAR BENIH PADA PADI VARIETAS UNGGUL LOKAL SUMATERA BARAT

Fitrah, Qalbina (2024) DETEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PATOGEN TULAR BENIH PADA PADI VARIETAS UNGGUL LOKAL SUMATERA BARAT. Diploma thesis, Universitas Andalas.

	Text (Cover dan Abstrak) COVER & ABSTRAK.pdf - Published Version Download (112kB)
	Text (Bab 1. Pendahuluan) BAB I. PENDAHULUAN.pdf Download (70kB)
	Text (bab 5. Kesimpulan dan Saran) BAB V PENUTUP.pdf Download (26kB)
	Text (Daftar Pustaka) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (221kB)
	Text (Skripsi Full text) SKRIPSI FULL.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Kelompok bakteri merupakan salah satu patogen penting yang ada pada tanaman padi. Burkholderia glumae, Acidovorax avenae subsp.avenae, dan Xanthomonas oryzae pv. oryzae merupakan bakteri patogen tanaman padi yang juga dapat ditularkan melalui benih. Penelitian ini bertujuan mendeteksi serta mengidentifikasi bakteri patogen tular benih pada benih padi varietas unggul lokal asal Sumatera Barat. Penelitian ini terdiri dari tiga tahapan yaitu (1) isolasi bakteri patogen tular benih, (2) identifikasi secara biokimia, (3) identifikasi secara molekuler. Untuk deteksi patogen tular benih parameter yang diamati adalah benih kering, bentuk makroskopis koloni bakteri, reaksi hipersensitif, dan uji patogenesitas. Untuk karakteristik biokimia diamati Gram, Oksidatif/Fermentatif, pigmen fluorescent, enzim katalase, dan enzim oksidase. Pengujian molekuler yang diamati adalah elektroforesis DNA genom, kuantifikasi DNA genom, Amplifikasi DNA, dan analisi bioinformatika. Hasil penelitian deteksi dan identifikasi bakteri dari benih padi lokal asal Sumatera Barat secara morfologi dan biokimia menunjukkan isolat KK 1 dan BM 2 diduga sebagai bakteri patogen dari genus Acidovorax. Isolat KK 2, KK 3, KK7, KK 8, KK 10, KK 12, dan AD 1 diduga bakteri patogen dari genus Xanthomonas. Isolat KK 4 dan KK 11 diduga bakteri patogen dari genus Burkholderia. Analisis nukleotida gen 16S rRNA menggunakan primer universal 27f dan 1525r menunjukkan isolat AD1 memiliki kemiripan 98,90% dengan Sphingomonas sp. penyebab penyakit hawar daun bakteri pada tanaman padi yang belum pernah dilaporkan di Indonesia. Kata kunci: Filogenetika, Isolasi bakteri, PCR-Sekuensing, Sphingomonas sp., Uji Biokimia bakteri

Actions (login required)

View Item