INTERAKSI MOLEKULER PROTEIN REPLICASE (REP) GEMINIVIRUS ISOLAT PESISIR SELATAN DENGAN PROMOTOR GEN NPR1

Ifan, Aulia Candra (2019) INTERAKSI MOLEKULER PROTEIN REPLICASE (REP) GEMINIVIRUS ISOLAT PESISIR SELATAN DENGAN PROMOTOR GEN NPR1. Masters thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Cover and Abstrak) abstrak.pdf - Published Version Download (146kB) | Preview
Preview	Text (BAB I) BAB I Pendahuluan.pdf - Published Version Download (44kB) | Preview
Preview	Text (bab v) BAB V Penutup.pdf - Published Version Download (35kB) | Preview
Preview	Text (dapus) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (297kB) | Preview
	Text (Tesis full text) Tesis Full text.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (2MB)

Abstract

Protein Replicase dianggap sebagai kunci determinan patogenesitas Pepper Yellow Leaf Curl Virus (PepYLCV). Disamping itu, gen NPR1 merupakan regulator kunci Systemic Acquired Resistance (SAR) terhadap invasi phytophatogen. Kedua molekul fungsional tersebut di dalam sel pada kondisi alamiahnya diasumsikan memiliki interaksi. Penelitian ini bertujuan untuk menyelidiki apakah protein Rep dapat berinteraksi dengan promoter gen NPR1. Investigasi dilakukan dengan menggunakan metode Electrophoteric Mobility Shift Assay (EMSA) terhadap promoter core dan distal gen NPR1. Studi telah berhasil membuktikan terjadinya interaksi antara protein Rep dengan promoter gen NPR1 secara In-vitro dan InSilico. Interaksi terjadi hanya pada promoter distal gen NPR1 fragmen 2 (DP_CbNPR1-F2), sedangkan interaksi dengan CP_CbNPR1 tidak terdeteksi. Analisis In-Silico menggunakan software HDOC memperlihatkan prediksi terbaik interaksi Rep-DP_CbNPR1-F2.4 adalah dengan skor docking dan ligan rmsd berturut-turut adalah -176.56 dan 26.80 Å. Berdasarkan hasil maka disimpulkan bahwa terdapat interaksi antara protein Rep dengan promoter distal gen NPR1.

Actions (login required)

View Item