ISOLASI DAN IDENTIFIKASI PROMOTOR INTI GEN NPR1 DARI TANAMAN CABAI (Capsicum annuum L.) GENOTIPE BERANGKAI

Yesi, Marlinda (2019) ISOLASI DAN IDENTIFIKASI PROMOTOR INTI GEN NPR1 DARI TANAMAN CABAI (Capsicum annuum L.) GENOTIPE BERANGKAI. Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Abstrak) Abstract.pdf - Published Version Download (117kB) | Preview
Preview	Text (BAB I Pendahuluan) Pendahuluan.pdf - Published Version Download (240kB) | Preview
Preview	Text (BAB Akhir (Kesimpulan)) BAB V Yesi.pdf - Published Version Download (32kB) | Preview
Preview	Text (Daftar Pustaka) Daftar Pustaka.pdf - Published Version Download (237kB) | Preview
	Text (Skripsi Full Text) full text Yesi.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (3MB)

Abstract

Protein NPR1 merupakan regulator utama sistem ketahanan tanaman berbasis Systemic Acquired Resistance (SAR) melalui pengaturan ekspresi sejumlah gen ketahanan dengan melibatkan senyawa asam salisilat. Promotor inti gen NPR1 berlokasi dekat dengan titik awal segmen Open Reading Frame (ORF) dan dicirikan dengan adanya sisi binding site polymerase II serta memiliki beberapa Cis-acting element untuk berinteraksi dengan beberapa faktor transkripsi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi karakteristik susunan segmen promotor inti gen NPR1 dari tanaman cabai (Capsicum annum L.) genotipe Berangkai dan keberadaan Cis-acting element. Informasi tersebut dapat dijadikan sebagai sumber referensi dalam rangka rekayasa peran gen NPR1 untuk peningkatan ketahanan tanaman terhadap berbagai cekaman baik biotik maupun abiotik. Penelitian ini berhasil mengisolasi promotor inti gen NPR1 dengan fragmen yang berukuran 4.050 bp. Fragmen diisolasi menggunakan primer spesifik yang dikombinasikan dengan strategi primer walking. Berdasarkan analisis BLASTn, promotor inti gen NPR1 memiliki tingkat homologi yang sangat tinggi dengan Zunla-1 yaitu 99 %. Karakterisasi lebih lanjut menggunakan PLACE a Database of Plant Cis-acting Regulatory DNA Element mendapatkan berbagai Cis-acting element berupa W-box, RAV1AAT, ASF-1, TATA-box, CAAT-box, GARE, GT1, MYB, I-box. Selain itu juga ditemukan adanya elemen enhancer berupa CCAAT-box. Penelitian lebih lanjut berupa eksperimen empiris secara in vitro dengan cara konstruksi dan analisis fungsional promotor perlu dilakukan untuk menggali lebih jauh fungsi dari masing-masing Cis-acting element tersebut. Kata kunci: Systemic Acquired Resistance, Non-Expressor of Pathogenesis Related 1, promotor inti, Cis-acting element, genotipe Berangkai

Actions (login required)

View Item