Isolasi dan Karakterisasi Promotor Distal Gen NPR1 dari Tanaman Cabai(Capsicum annuum L.)

Maythesya, Oktavioni (2018) Isolasi dan Karakterisasi Promotor Distal Gen NPR1 dari Tanaman Cabai(Capsicum annuum L.). Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (abstrak) abstrak .pdf - Published Version Download (149kB) | Preview
Preview	Text (BAB I PENDAHULUAN thesya) BAB I PENDAHULUAN thesya.pdf - Published Version Download (131kB) | Preview
Preview	Text (BAB V thesya) BAB V thesya.pdf - Published Version Download (122kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA thesya) DAFTAR PUSTAKA thesya.pdf - Published Version Download (345kB) | Preview
	Text (full) full.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Protein NPR1 adalah regulator utama dari sistem ketahanan tanaman terhadap patogen berupa bakteri, jamur, virus, dan nematoda. Sistem ketahanan ini dikenal dengan Systemic Acquired Resistance (SAR). Ekspresi gen NPR1 diinduksi oleh patogen dan senyawa asam salisilat (AS). Promotor distal adalah sekuen regulator penting yang mengandung elemen cis-acting, enhancer, dan silencer yang berperan dalam inisiasi transkripsi gen. Elemen cis-acting yang sering ditemukan pada promotor gen yang diinduksi oleh patogen dan AS berupa elemen W-box, RAV1AAT, dan ASF1. Penelitian ini bertujuan untuk memberikan informasi terkait struktur dan peran promotor distal gen NPR1 sebagai referensi dalam interaksi elemen cis-acting dengan faktor transkripsi dan optimalisasi promotor, serta perakitan tanaman transgenik yang tahan geminivirus. Sekuen promotor distal gen NPR1 (PD_CbNPR1) diisolasi dari DNA genom cabai genotipe Berangkai menggunakan primer spesifik. Elemen-elemen cis-acting dikarakterisasi dengan PLACE a Database of Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements. Sekuen PD_CbNPR1 yang berhasil diisolasi berukuran 5.950 bp yang berada pada posisi 4.051-10.000 bp dari ATG. Elemen-elemen cis-acting yang ditemukan pada promotor distal PD_CbNPR1 berupa W-box, WLE1, RAV1AAT, TATA-box, CAAT-box, GARE, dan GT1, selain ini juga ditemukan adanya elemen enhancer dan silencer. Empat elemen enhancer yang ditemukan pada PD_CbNPR1 adalah CCAAT-box. Sedangkan elemen silencer yang ditemukan berjumlah satu buah dengan urutan konsensus GAGAAATT. Agar fungsi dan peran masing-masing elemen PD_CbNPR1 (cis-acting, enhancer, dan silencer) dalam regulasi ekspresi gen NPR1 dapat diketahui, penelitian lanjutan berupa analisis in-vitro dengan cara konstruksi dan analisis fungsional promotor perlu dilakukan. Kata kunci : CCAAT-box, gen NPR1, promotor distal, RAV1AAT, W-box

Actions (login required)

View Item