IDENTIFIKASI MOLEKULER, KLONING DAN KARAKTERISASI IN-SILICO GEN-GEN KITINASE DARI BEBERAPA ISOLAT RHIZO- DAN PHYLOBACTERIA BERSIFAT ANTIANTRAKNOSA

ELLY, SYAFRIANI (2017) IDENTIFIKASI MOLEKULER, KLONING DAN KARAKTERISASI IN-SILICO GEN-GEN KITINASE DARI BEBERAPA ISOLAT RHIZO- DAN PHYLOBACTERIA BERSIFAT ANTIANTRAKNOSA. Doctoral thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Cover dan Abstrak) COVER DAN ABSTRAK.pdf - Published Version Download (132kB) | Preview
Preview	Text (BAB I) BAB I.pdf - Published Version Download (234kB) | Preview
Preview	Text (BAB V) BAB V.pdf - Published Version Download (112kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (529kB) | Preview
	Text (DISERTASI FULL TEXT (ELLY SYAFRIANI)) disertasi full text Elly Syafriani.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (4MB)

Abstract

IDENTIFIKASI MOLEKULER, KLONING DAN KARAKTERISASI IN-SILICO GEN-GEN KITINASE DARI BEBERAPA ISOLAT BAKTERI RHIZOSFER DAN FILOPLAN BERSIFAT ANTIANTRAKNOSA Oleh: Elly Syafriani (1331611005) (Di bawah bimbingan: Prof. Dr. sc. agr. Ir. Jamsari, M.P.; Prof. Fatchiyah, M.Kes., Ph.D.; dan Dr. rer. nat. Syafrizayanti, S.Si., M.Si.) Serangan penyakit antraknosa oleh jamur Colletotrichum gloeosporioides menimbulkan kerugian signifikan terhadap beberapa tanaman penting. Untuk mengatasi permasalahan ini, dikembangkan senyawa biofungisida dari bakteri antagonis penghasil senyawa antijamur. Empat isolat bakteri dengan kemampuan antagonis terbaik terhadap jamur C. gloeosporioides yaitu UBCR_12, UBCR_36, UBCF_01 dan UBCF_13 telah diidentifikasi secara molekuler dan diketahui tiga diantaranya yaitu UBCR_12, UBCF_01 dan UBCF_13 adalah Serratia plymuthica dan UBCR_36 adalah Pseudomonas lurida. Atas dasar studi literatur, diketahui bahwa jenis bakteri S. plymuthica mampu menghasilkan senyawa enzim kitinase yang efektif menghambat pertumbuhan jamur C. gloeosporioides. Untuk itu, dilakukan pengisolasian gen-gen pengkode senyawa enzim kitinase dari isolat yang teridentifikasi sebagai S. plymuthica melalui metode kloning berbasis PCR. Empat pasang primer spesifik yang telah didesain dari penelitian ini, berhasil mengisolasi dan mengamplifikasi gen-gen pengkode kitinase yang menjadi target yaitu ChiA, ChiB, ChiC dan 1281 bp-putative chitinase. Analisis sekuens yang dilakukan terhadap keempat gen memberikan prediksi fungsionalitas masing-masing gen tersebut. Seluruh data yang diperoleh dari penelitian ini dapat digunakan sebagai informasi dasar dalam pengembangan enzim kitinase dari S. plymuthica sebagai biofungisida. Kata kunci: antraknosa, biofungisida, Serratia plymuthica, kitinase dan analisis sekuens.

Actions (login required)

View Item