ISOLASI DAN KLONING GEN PENGKODE METALLOPROTEASE DARI ISOLAT UBCR_12, UBCF_01 DAN UBCF_13

HUSNUL, RAHMI (2018) ISOLASI DAN KLONING GEN PENGKODE METALLOPROTEASE DARI ISOLAT UBCR_12, UBCF_01 DAN UBCF_13. Diploma thesis, Universitas andalas.

Preview	Text (COVER DAN ABSTRAK) cover-abstrak.pdf - Published Version Download (2MB) | Preview
Preview	Text (BAB I) BAB I PENDAHULUAN.pdf - Published Version Download (367kB) | Preview
Preview	Text (BAB V) BAB V KESIMPULAN DAN SARAN.pdf - Published Version Download (421kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA) DAFTAR PUSTAKA.pdf - Published Version Download (336kB) | Preview
	Text (SKRIPSI FULL) skripsi husnul lengkap.pdf - Published Version Restricted to Repository staff only Download (5MB)

Abstract

Metalloprotease merupakan jenis enzim protease yang memerlukan ion logam untuk aktivasinya. Metalloprotease berpotensi dalam penekanan serangan hama dan dimanfaatkan dalam pengembangan sebagai insektisida alami. Tujuan dari penelitian ini adalah mengisolasi dan mengkloning gen metalloprotease dari bakteri Serratia plymuthica strain UBCR-12, UBCF_01 dan UBCF_13 untuk mengetahui karakteristik sekuen gen tersebut. Analisis bioinformatika menunjukkan bahwa panjang sekuen ORF gen metalloprotease dari masing-masing isolat adalah 780 bp yang mengkode 259 asam amino. Analisis conserve domain memperlihatkan bahwa domain gen metalloprotease dari ketiga isolat adalah domain M48C_IoiP_like yang memiliki Zn binding site. Analisis permodelan struktur 3 dimensi protein menunjukkan bahwa gen metalloprotease dari ketiga isolat memiliki kemiripan dengan protein putative Zn-dependent peptidase. Sedangkan analisis filogenetik memperlihatkan bahwa gen metalloprotease dari ketiga isolat memiliki kekerabatan yang dekat dengan S. plymuthica strain PRI-2C dengan nilai identity sebesar 95% Kata kunci: metalloprotease, kloning gen, Serratia plymuthica, Zn-dependent peptidase.

Actions (login required)

View Item