METODE POLYMERASE CHANGE RAECTION-RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM (PCR-RFLP) UNTUK DETEKSI SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM (SNP) GEN ERBB2 PADA PASIEN KANKER PAYUDARA

Miftahu, Saadah (2016) METODE POLYMERASE CHANGE RAECTION-RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM (PCR-RFLP) UNTUK DETEKSI SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM (SNP) GEN ERBB2 PADA PASIEN KANKER PAYUDARA. Diploma thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Cover and abstrak) cover abstrak upload.pdf Download (131kB) | Preview
Preview	Text (BAB I) BAB I upload.pdf Download (119kB) | Preview
Preview	Text (BAB V) BAB V upload.pdf Download (110kB) | Preview
Preview	Text (DAFTAR PUSTAKA) Dapus upload.pdf Download (178kB) | Preview
	Text (skripsi full) skripsi fix upload.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Single nucleotide polymorphism (SNP), yang terdapat pada Human Ephidermal Receptor factor 2 (HER2) yang dikenal juga dengan nama ERBB2 telah ditemukan pada beberapa jenis kanker. Gen ini diketahui memiliki beberapa SNP yang berkaitan dengan beberapa jenis kanker salah satunya adalah SNP I655V dimana mutasi alelnya mengalami perubahan dari isoleusin menjadi valin. SNP I655V pada ERBB2 dilaporkan dapat dijadikan sebaga faktor resiko kanker payudara dan prediksi respon penggunaan obat herceptin (trastuzumab) pada pasien kanker payudara. Oleh karena itu, tujuan penelitian ini adalah mendeteksi polimorfisme I655V (rs1136201) pada pasien kanker payudara dengan menggunakan sebuah metode yang sederhana dan ekonomis yaitu PCR-RFLP (restriction fragment length polymorphism). Pertama-tama, deteksi SNP dimulai dengan mengamplifikasi DNA dengan menggunakan primer yang dirancang spesifik untuk ERBB2. Selanjutnya produk PCR dengan panjang 164 bp dipotong dengan enzim BsmAI sehingga menghasilkan fragmen DNA dengan panjang 98 dan 66 bp. SNP I655V juga dikonfirmasi dengan penentuan urutan nukleotida dari PCR produk. Dari delapan belas sampel yang diamplifikasi, ditemukan empat sampel yang memiliki SNP ERBB2 I655V dan empat belas sampel lainnya merupakan ERBB2 dalam bentuk normal (wild type). Dengan demikian primer yang dirancang dan enzim restriksi yang dipilih berhasil digunakan untuk metoda PCR-RFLP sebagai pendeteksi SNP I655V gen ERBB2 secara cepat, spesifik dan ekonomis. Kata kunci: Kanker payudara, SNP, PCR-RFLP, ERBB2

Actions (login required)

View Item