ANALISA VARIASI MOLEKULER DAN FILOGENETIK GEN E7 ISOLAT HPV18 DARI PENDERITA KANKER SERVIKS

Arfiandi, Arfiandi (2016) ANALISA VARIASI MOLEKULER DAN FILOGENETIK GEN E7 ISOLAT HPV18 DARI PENDERITA KANKER SERVIKS. Masters thesis, Universitas Andalas.

Preview	Text (Abstrak) ABSTRAK.pdf - Published Version Download (191kB) | Preview
Preview	Text (Bab 1. Pendahuluan) BAB I. PENDAHULUAN.pdf - Published Version Download (236kB) | Preview
Preview	Text (Ban VI. Kesimpulan dan Saran) BAB VI. KESIMPULAN DAN SARAN.pdf Download (210kB) | Preview
Preview	Text (Daftar Pustaka) DAFTAR PUSTAKA.pdf Download (458kB) | Preview
	Text (Tesis Full Text) THESIS FULL TEXT.pdf Restricted to Repository staff only Download (10MB)

Abstract

Penelitian ini dirancang untuk menganalisa variasi genetik yang mungkin terjadi pada gen E7 HPV18. Isolat Sampel diperoleh dari Pusat Penelitian HPV Fakultas Kedokteran Universitas Andalas yang berasal dari berbagai daerah di Padang dan Pekanbaru. Isolat HPV18 E7 disekuensing kemudian dianalisa selanjutnya dibangun pohon filogeni (kekerabatan). Dari lima isolat yang dianalisa, terdapat dua silent mutation (C162T/Alanin) pada sampel HPV18M8, HPV18M11 dan satu missense mutation (G158A/Arginin/Glutamin pada posisi asam amino 47 (R47Q)) pada sampel HPV18M12. Sedangkan pada sampel HPV18M4 dan HPV18M15 relatif stabil. Berdasarkan analisa pohon filogeni, HPV18M4, HPV18M12 dan HPV18M15 termasuk lineage Asia-Amerika dengan mean distance 0,006 sedangkan HPV18M8 dan HPV18M11 termasuk lineage Eropa dengan mean distance 0,036. Tidak ditemukan varian Afrika pada lima isolat sampel yang digunakan dalam penelitian ini. Perlu penelitian lebih lanjut terhadap potensi onkogenik dari mutasi R47Q.

Actions (login required)

View Item